Au XVIe siècle, avec l'apparition de nouveaux ordres religieux, les moines capucins s'installèrent sur la colline, où ils construisirent un couvent. Lors des travaux d'agrandissement réalisés entre 1584 et 1587, une citerne fut aménagée pour y accumuler 700 mètres cubes d'eau. Elle se composait de trois grandes salles séparées par des colonnes. Le tunnel souterrain qui y mène fut probablement construit à l'origine pour accéder à une crypte ou à d'autres bâtiments religieux souterrains.
La construction fut conservée lors de l'édification d'un fort pendant la guerre de Succession (1707) et la guerre d'indépendance espagnole (1808-1809).