Comme déjà mentionné, ce musée est situé dans un ancien couvent de moines capucins du XVIIIe siècle, qui en 1845 devint le premier Institut d'enseignement secondaire de Gérone et l'un des premiers de Catalogne. Les instruments et éléments utilisés par les élèves, filles et garçons (il y avait aussi des filles à l'Institut), dans les cours de sciences, ont été conservés au Musée et rappellent cette époque où Gérone était la capitale à bien des égards : éducative, culturelle, politique, économique, administrative, industrielle et des communications ; ce dernier grâce, précisément, au train qui, depuis 1862, relie la ville à Barcelone et au monde.