El Museu d'Història dels Jueus ofereix una programació variada/diversa d'activitats didàctiques adreçades a nuclis familiars i grups amb infants amb l'objectiu de despertar la curiositat pel passat medieval i per la cultura jueva.
Al llarg de l'any es proposen tallers participatius, activitats temàtiques, visites guiades, contacontes i material d'ús autònom perquè els més petits descobreixin com vivien i qui eren els antics habitants del Call de Girona.
El Museu d'Història dels Jueus col·labora i difon, juntament amb els altres museus locals de Girona, els membres del GironaMuseus, algunes activitats relacionades amb festes locals i esdeveniments per promocionar la cultura i el patrimoni.
Gràcies a la Xarxa de museus de les Comarques de Girona, el museu participa en les activitats de Nadal amb el "Llibret de Nadal" temàtic de cada centre museístic de vinculat la Xarxa, a l'estiu amb el "Passaport dels Museus" i a les diferents edicions de "Els Museus surten al carrer".